中医理论认为，菜籽油味甘、辛、性温，可润燥杀虫、散火丹、消肿毒，临床用于蛔虫性及食物性肠梗阻，效果较好。
人体对菜籽油的吸收率很高，可达99%，因此它所含的亚油酸等不饱和脂肪酸和维生素E等营养成分能很好地被机体吸收，具有一定的软化血管、延缓衰老之的功效。由于榨油的原料是植物的种实，一股会含有一定的种子磷脂，对血管、神经、大脑的发育十分重要。菜籽油的胆固醇很少或几乎不含，所以怕胆固醇的人可以放心食用。欧米伽3含量较高。
菜籽油中含有芥酸，主要存在于菜油中。动物实验证明，大量摄入含芥酸高的菜籽油，可致心肌纤维化引起心肌病变;引起动物增重迟缓，发育不良;生殖力下降，经试验公鼠饲料中芥酸含量达10%时，即出现睾丸变小，无成熟精子等现象;引起血小板下降。
